Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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USP35Q9P2H5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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USP35Q9P2H5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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USP35Q9P2H5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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