Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms