Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms