Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms