Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms