Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms