Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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