Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU2

USP28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP28Q96RU2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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USP28Q96RU2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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USP28Q96RU2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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USP28Q96RU2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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USP28Q96RU2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP28Q96RU2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP28Q96RU2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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USP28Q96RU2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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USP28Q96RU2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP28Q96RU2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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