Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms