Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GPR78Q96P69 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms