Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms