Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNERQ8NFT8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNERQ8NFT8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms