Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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