Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRC17Q8N6Y2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRC17Q8N6Y2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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