Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC71Q8N4P6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms