Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms