Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms