Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms