Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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