Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms