Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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