Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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GRIK4Q16099 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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GRIK4Q16099 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GRIK4Q16099 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GRIK4Q16099 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GRIK4Q16099 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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GRIK4Q16099 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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