Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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VAMP3Q15836 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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