Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms