Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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