Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTCH1Q13635 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTCH1Q13635 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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