Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSTA3Q13630 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms