Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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