Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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