Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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