Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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