Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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