Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TROQ12816 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TROQ12816 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TROQ12816 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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