Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGEF5Q12774 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGEF5Q12774 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGEF5Q12774 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGEF5Q12774 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGEF5Q12774 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGEF5Q12774 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGEF5Q12774 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms