Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms