Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms