Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms