Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CASP9P55211 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASP9P55211 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASP9P55211 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASP9P55211 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms