Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms