Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP4P49662 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms