Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms