Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms