Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms