Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms