Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OTX2P32243 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OTX2P32243 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms