Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms