Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DESP17661 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms