Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms