Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC008443.1-204ENST00000417281 629 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL121972.2-202ENST00000429386 586 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC012150.1-201ENST00000553075 593 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms