Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms